數碼寶貝6 合體大作戰

故事講述中學一年級的少年工藤大器，偶然獲得了神祕的「數碼合體機（Xros Loader）」，並與朋友們一同被捲入數碼世界。當時的數碼世界正處於群雄割據的戰亂時代，大器與搭檔高吼獸組成了軍團「Xros Heart」，為了拯救陷入苦難的數碼寶貝並恢復和平，展開了對抗邪惡「巴古拉軍」的冒險征途。

本作打破了傳統數碼寶貝單一個體「進化」的常規，引入了全新的「數碼合體（DigiXros）」系統。人類指揮官透過數碼合體機，能將多隻數碼寶貝合而為一，創造出擁有全新外型與強大力量的複合體。戰鬥模式也從以往的單打獨鬥，轉變為強調團隊配合與陣型的「軍團作戰」。

本作的數碼世界因為過去的戰爭而四分五裂，被切割成無數個稱為「Zone（地帶）」的獨立區域。每個 Zone 都由一塊名為「Code Crown（代碼王冠）」的資料晶片所支配。只要奪得該區域的 Code Crown，就能成為該地帶的統治者並改變其地形環境，這也成為各方勢力爭奪的核心目標。

除了企圖以武力與高壓統治所有地帶的最大反派「巴古拉軍」之外，大器還必須面對其他同樣擁有人類指揮官的軍團。例如信奉絕對力量、由蒼沼切羽率領的「Blue Flare（藍軍）」，以及行動神祕莫測、由天野音音帶領的「Twilight（黑軍）」。人類軍團彼此間的理念衝突與勢力制衡，是故事前期的一大看點。